長崎大學(xué)作為日本歷史最悠久的公立醫(yī)學(xué)校，醫(yī)學(xué)部前身長崎醫(yī)科大學(xué)在1945年8月9日受到原子彈轟炸。1949年建校，位于長崎縣長崎市的日本國立大學(xué)、引舊六所醫(yī)科官立大學(xué)之一。1949年由長崎醫(yī)科大學(xué)、長崎醫(yī)科大學(xué)附屬藥學(xué)專門部、長崎經(jīng)濟專門學(xué)校(二戰(zhàn)前為長崎高等商業(yè)學(xué)校)、長崎師范學(xué)校、長崎青年師范學(xué)校、引長崎高等學(xué)校合并而成。其時日本歷史最悠久的公立醫(yī)學(xué)校。其校友包括了2008年諾貝爾化學(xué)獎得主下村修。